大多数新啤酒厂都与市政供水系统相连，而市政供水系统中的水都经过氯化处理。
随着新的手工酿酒厂在全国范围内迅速扩张，许多酿酒厂在水处理方面采取了 “最小化 “的方法，以降低初始资本成本，这并不奇怪。
水是酿造过程中的重要成分，必须确保水的质量，才能生产出优质啤酒。 然而，许多手工酿酒厂需要更多的资金或资源来投资昂贵的水处理系统。 为此，这些啤酒厂选择了一种成本效益更高的方法，但仍然符合生产优质啤酒的标准。
许多新啤酒厂都在使用市政供水系统，而市政供水系统通常会对水进行氯化处理。 为了去除氯，他们使用颗粒活性炭 (GAC)。 有些酿酒厂会在糖化前改变水的化学成分，有些则使用除氯水。 这有助于从谷物中提取糖分。
酿酒师们普遍存在一种误解，认为煮沸麦汁和使用氯化水可以防止微生物污染。 不过，一些微生物能抵抗氯的侵蚀，并能在有适当养分的条件下茁壮成长，这一点已得到公认。 这凸显了采取额外措施确保最终产品的安全和质量的重要性。
使用 GAC 可能会导致下游污染，因为它会为有害生物提供滋生地。 此外，如果在糖化过程前不进行处理，嗜热菌和一些耐氯微生物可以在煮沸后存活下来，并造成麦汁污染。 酿造研究所发表了一篇文章，揭示了麦芽汁中常见的 麦芽汁中常见的肠杆菌、 包括柠檬酸杆菌、肠杆菌和克雷伯氏菌。 这些生物会减缓发酵过程并改变 pH 值，从而导致啤酒风味和口感的不一致，尤其是燃料酒精、酯类、硫化合物、羰基化合物和挥发性酚类。
麦芽酿造和酿造微生物学》更详细地介绍并强调了麦芽浆或麦汁中的芽孢杆菌和梭状芽孢杆菌的潜在危险，它们会导致过度酸化、亚硝胺的形成或丁酸的产生。 在糖化之前解决污染问题可以提高过滤性和萃取效率，酿造过程中各个阶段常见的微生物包括
一些酿酒商已经开始在 GAC 床之后使用紫外线净化系统，以对付微生物污染物，例如耐氯生物、嗜热菌和其他在 GAC 床中滋生的有害菌种。
感官评估和感官检查足以确定造成质量和一致性问题的特定污染物，因为许多微生物污染物都会产生明显的风味和香气问题。 采用紫外线系统，在检测到糖化过程水中的生物体后，使用适当的紫外线剂量，可降低污染风险。
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